小干擾RNA(siRNA)轉染細胞是常用的基因沉默技術,以下為相關操作技巧:
一、轉染前細胞準備
- 細胞狀態(tài):
- 細胞需處于良好生長狀態(tài),活力要在90%以上。比如貼壁細胞,轉染前剛完成一次傳代,處于對數生長期,此時細胞代謝旺盛,攝取外界物質能力強,利于siRNA轉染。
- 要避免細胞過度密集或稀疏。細胞過于密集會使營養(yǎng)和空間不足,影響轉染效率;過于稀疏則難以檢測轉染后細胞產生的生物學效應。貼壁細胞匯合度在70 - 80%左右轉染較合適。
- 培養(yǎng)基更換:
- 轉染前需更換新鮮培養(yǎng)基,因舊培養(yǎng)基成分可能干擾轉染試劑和siRNA活性。含高濃度血清的培養(yǎng)基可能與轉染試劑結合,降低轉染試劑 - siRNA復合物形成效率,一般建議用無血清或低血清培養(yǎng)基轉染。
二、siRNA準備
- 質量檢測:
- 確認siRNA的純度和完整性,可用瓊脂糖凝膠電泳檢測是否降解,高質量siRNA電泳時應呈現(xiàn)清晰條帶,無拖尾現(xiàn)象。
- 測定siRNA濃度,其精確濃度對確定轉染試劑用量和轉染復合物比例很關鍵,通常用紫外分光光度計測其在260nm波長處吸光度來計算濃度。
- 設計優(yōu)化:
- 合理設計siRNA序列,要特異性針對目標基因,避免與其他非靶基因有較高同源性以減少脫靶效應,可借助生物信息學軟件輔助設計,設計后最好通過實驗驗證有效性。
- 對于難轉染的細胞或基因,可嘗試不同siRNA序列轉染,或采用化學修飾的siRNA提高轉染效率和穩(wěn)定性。
三、轉染試劑選擇與使用
- 選擇合適的轉染試劑:
- 依細胞類型選轉染試劑,不同細胞對其敏感性不同。例如脂質體類適用于多種細胞類型,但對某些原代細胞或難轉染細胞,可能需用陽離子聚合物類轉染試劑或病毒載體實現(xiàn)高效轉染。
- 考慮轉染試劑毒性,部分轉染試劑可能致細胞死亡或生長異常,選擇時需查閱文獻或做預實驗評估毒性。
- 優(yōu)化轉染試劑 - siRNA復合物的形成:
- 嚴格按轉染試劑說明書制備復合物,一般在無血清緩沖液中混合轉染試劑和siRNA,注意混合順序,通常先加轉染試劑入緩沖液輕輕混勻,再加siRNA,然后孵育一段時間讓復合物充分形成。
- 優(yōu)化轉染試劑和siRNA的比例,不同組合可能需不同比例達好的轉染效果,可設比例梯度實驗確定合適用量。
四、轉染過程操作
1. -加樣方式:
2. - 將轉染試劑 - siRNA復合物加入細胞培養(yǎng)孔或培養(yǎng)瓶時,要緩慢滴加,邊滴加邊輕輕晃動培養(yǎng)容器,使復合物均勻分布,避免局部濃度過高致細胞損傷或轉染不均勻。
3. - 對于貼壁細胞,盡量將復合物直接滴加到培養(yǎng)基中,不接觸細胞表面,減少對細胞的機械損傷。
4. - 轉染時間和溫度:
5. - 控制轉染時間,不同轉染試劑和細胞類型所需轉染時間不同,一般轉染復合物和細胞孵育時間在4 - 24小時之間,過長孵育時間可能增加轉染試劑毒性,過短則轉染效率低下。
6. - 注意轉染溫度,多數轉染在37°C進行,但對溫度敏感的轉染試劑或細胞,可能需在較低溫度下轉染以提高效率和細胞存活率。
五、轉染后處理
1.培養(yǎng)基更換:
- 轉染后適時更換培養(yǎng)基,若轉染試劑毒性大,轉染后4 - 6小時就應換為含血清的完全培養(yǎng)基,減少其對細胞持續(xù)傷害,但若換得過早,可能導致轉染復合物還未充分發(fā)揮作用就被移除,要依實際情況調整。
2. 檢測時間點選擇:
- 合理選擇檢測基因沉默效果的時間點,一般轉染后24 - 72小時內可檢測到目標基因表達下降,但不同基因和細胞類型會有差異,可用實時定量PCR或Western blotting等方法檢測基因沉默效果。
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